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二手美國Illumina 新一代基因測序儀 高通量

簡要描述:二手美國Illumina 新一代基因測序儀
快速運行模式下HiSeq 2500系統上人類基因組2 x 101 bp運行的質量值。這個例子表明,92%的堿基高于Q30。

的數據質量和存儲方案

Illumina生物信息學的新發展包括數據壓縮改善、測序比對算法更快,以及一套即插即用的數據計算和存儲方案。

  • 產品型號:Hisep2500
  • 廠商性質:經銷商
  • 更新時間:2022-01-13
  • 訪  問  量:276
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品牌其他品牌產地類別進口
應用領域醫療衛生,生物產業

二手美國Illumina 新一代基因測序儀

HiSep 2500新一代測序儀

qiansuoweiyou的靈活性

HiSeq 2500系統是Illumina第一臺特有兩種運行模式的測序系統,包括快速運行和高產量運行模式,可使用一個或兩個流動槽,使之成為一個靈活且可擴展的平臺??焖龠\行模式提供快速的結果、數量有限樣品的高效處理,以及更長的末端配對150 bp讀取,這帶來了更深度的覆蓋,并改善de novo應用的組裝。高產量模式特別適合樣品量較多的大型研究,或需要最深度覆蓋的應用。高產量模式可處理的樣品量是快速模式的~5倍,讓大型項目可通過盡可能少的運行來完成。

HiSeq 2500的多個配置讓產量可調,既能在7小時內獲得~10 Gb或~3億個單端讀取,又能在11天內獲得600 Gb或60億個末端配對讀取,這取決于應用需求或項目期限。高效的樣品批處理從未如此簡單,而周轉時間也從未如此之快。HiSeq 1500也具有這兩種運行模式,支持單個流動槽,而不是兩個。HiSeq 1500/2500系統讓您的實驗室擁有qiansuoweiyou的靈活性,以便支持*泛的應用和研究規模。

驚人的速度和通量

快速運行模式是HiSeq系統設計上的一個革命性附加,它通過縮短的循環時間和內置的簇生成來顯著加快運行。在快速運行模式下,您能夠完成全自動的簇生成和測序,在一個工作日內實現短讀取應用,或在一天多的時間內通過末端配對100 bp讀取實現全基因組測序應用。數據通量超過100 Gb,因此一天內人類基因組的測序覆蓋度超過30倍(圖1)。在需要快速且準確的答案時,快速運行時間再加上zhuoyue的數據質量很關鍵??焖龠\行模式的加速運行以及平行處理約6億個測序模板的能力帶來了現有測序系統中最高的每日通量。

有了兩種運行模式以及使用一個或兩個流動槽的能力,HiSeq 2500支持廣泛的應用和研究規模。本圖中的數據是例子,基于使用兩個流動槽的系統性能。因簇密度、樣品質量,及其他實驗因素不同,可能會出現差異。運行時間是近似的,快速運行模式包括簇生成和測序,而高產量模式只包括測序。添加索引的運行時間未包括在內。

出色的數據質量

二手美國Illumina 新一代基因測序儀

高的數據質量是通過行業中*泛采用的邊合成邊測序(SBS)技術的應用來確保的。HiSeq 1500/2500系統的SBS技術利用zhuanli的可逆終止子方法對數百萬個片段進行測序,在單個堿基摻入增長的DNA鏈時檢測它們。由于每個測序循環中四種與可逆終止子結合的dNTP都存在,故自然競爭讓摻入偏向最小化,與其他技術相比大大降低了原始錯誤率。最終結果是高度準確的base-by-base測序,幾乎避免了序列背景特異的錯誤,即使是在那些重復序列區和同聚物中。Illumina測序帶來了行業中任何覆蓋水平的最準確人類基因組、最高產量的無錯誤讀取以及最高比例的>Q30堿基檢出(

快速運行模式下HiSeq 2500系統上人類基因組2 x 101 bp運行的質量值。這個例子表明,92%的堿基高于Q30。

zhuoyue的數據質量和存儲方案

Illumina生物信息學的新發展包括數據壓縮改善、測序比對算法更快,以及一套即插即用的數據計算和存儲方案。

HiSeq 1500/2500軟件將數據體積縮小50%以上,而不會損害數據質量。這允許產量加倍,而無需將數據存儲能力擴大兩倍。HiSeq 1500/2500軟件還能夠與BaseSpace® 實時連接,這是一種云計算環境,可實現實時的堿基檢出、比對后的數據分析以及可擴展的數據存儲。將數據上傳至BaseSpace可實時進行,通常在運行完成幾分鐘后結束。BaseSpace中的數據上傳、數據比對或變異檢出不會產生任何額外的費用。研究人員可通過BaseSpace云端開展合作,與世界上的任何人即時安全地共享數據。

BaseSpace還提供Illumina序列分析和比較軟件(iSAAC™)- 目前最快的比對軟件。iSAAC軟件的速度有了4-6倍的提高,可在幾小時內將一個30x的基因組與參考基因組比對。比對可在BaseSpace中免費開展,或利用經濟的商業化計算硬件開展。iSAAC軟件對生物學家而言簡單易用,而對生物信息學家而言又足夠靈活,可訪問并修改開放源代碼。BaseSpace應用商店將提供更多的工具和軟件,帶來商業化、免費軟件和用戶開發應用的組合。


二手美國Illumina 新一代基因測序儀



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